Exchange的一個重要賣點是承諾與WindowNT集成。Microsoft經常強調Exchange充分利用了NT的目錄服務。不幸的是，這更多的是一種承諾而不是事實。由于NT域服務目錄的平面性和有限特性，Microsoft不得不建立為Exchange建立分離的目錄，只是表面式地在在管理界面上與到NT目錄連接，給用戶一個"集成"的印象。

事實上，Exchange目錄是獨立的，具有分離的目錄同步機制和完全不同的一套命名規則。Exchange目錄本身是十分受限制的，只有10來個可以定制的字段，其中只支持一個RTF字段。由于使用基于郵件的目錄同步機制，目錄同步缺乏準確性。所以Microsoft推薦管理員經常在Site間和Site內用一致性檢查程序來檢查同步的狀況，提示不準確的復制。對一個與業務密切相關的、企業級基礎設施的一部分，企業目錄具有如此的不確定性、不一致性，是不可接受的。

也許Microsoft在企業實施部署中往往造成拖延和失敗的最大原因就是Exchange的目錄限制。不論企業信息基礎設施、組織結構、機構調整兼并多么復雜，都必須在一個Exchange組織中使用單個目錄。這勢必限制了目錄效率、管理工作的分布、internet的連接等等。Microsoft已經宣布了Exchange下一版采用NT5.0的Active Directory，重新設計Exchange的體系結構，改進目錄服務，這不僅意謂著Exchange下一版將再次推遲(NT5.0不斷推遲)，更重要的是當前Exchange用戶將面臨著一次根本性的升級和繁重的遷移工作。

Lotus Domino/Notes支持幾乎無限制的對目錄的客戶化定制、擴展能力，采用先進的同步復制技術，支持復雜的分布式目錄支持，而且在在單個組織中也可以使用多個目錄。Lotus Domino/Notes的目錄服務性能與伸縮性在下一版(99年處推出)中將大大提高，如支持百萬級用戶的目錄支持。

安全性--身份驗證

MS Exchange的驗證依賴于NT域服務，而NT域服務的限制是眾所周知的。由于它是平面的，NT目錄服務很難擴展到大型企業中。NT域只能應付幾百個帳號，為了將NT目錄服務擴展到大的用戶環境就必須建立和管理復雜的信任關系。

其次，NT查詢/響應模式與基于證書的驗證模式相比較，功能薄弱，并且很不適應與遠程用戶以及跨企業內的連接。基于證書的驗證模式要求用戶除了知道保密口外還需持有數字證書，例如Domino的用戶驗證模式。基于證書的驗證模式還支持跨組織之間的交叉驗證，特別跨企業的通訊。

同樣地，Microsoft將在NT5.0中支持基于證書的驗證。為此，Exchange將重新修改體系結構，用戶將不得不付出遷移的代價。

安全性--權限控制

與Lotus Domino/Notes相比，MS Exchange提供十分有限的訪問控制能力。Lotus提供的訪問控制可以是數據庫、文件夾、文檔、或字段級。Lotus 同樣支持通過角色的訪問控制并保持ACL的一致性。這兩方面功能對于復雜的應用是十分重要的。同樣地，Exchange"將在下一版中改進"。

安全性--加密/數字簽字

這又是一個承諾與現實矛盾的例子。在市場宣傳上，Microsoft承諾Exchange將通過充分利用NT的功能，以實現最低的保有成本。然而，NT缺乏雙密鑰加密支持，所以Microsoft只能在Exchange服務器中捆綁北方電訊的EnTrust產品。

結果是管理員必須面對兩個單獨的服務器安裝，為每個用戶建立另外的帳號和保密口令以及煩瑣的例外安裝過程，這意味著在NT和Exchange的安全模式上另外附加分離的安全機制。最終用戶也不得已面對不統一的加密功能的設置、額外增加一個保密字記憶(并且使Exchange單次登錄變得無意義)，才能得到有限的加密/簽字功能。

對于Lotus Domino/Notes，先進的公鑰基礎設施自動地而且自然地集成到產品的體系結構之中。這使得加密/數字簽字功能的管理、安裝和使用簡單化。另外，Lotus還提供了其它產品尚不具備的功能，包括對收到郵件的自動加密、在郵遞和應用時的加密、字段級加密、密鑰的定制以及單個文檔上多個簽字。Domino支持RSA的加密功能以及就象SSL加密機制。

移動用戶的支持

Exchange和Outlook客戶端最大的缺陷之一就是對移動用戶缺乏足夠的支持。Mixrosoft使用從早已過時的MS Mail繼承下來的"脫線文件夾"，功能十分有限。Microsoft方案并不是工作在后臺(用戶必須等待完成)、只支持RSA連接(與Lotus X.PC連接相比建立時間更長)、只支持到文檔級(比字段級復制效率低)、不支持選擇性復制(需要更多的磁盤空間、效率也更低)、不能對目錄和空閑時間信息進行標注，而且只有最基本的適應性和控制管理能力提供最少的靈活性和控制(沒有圖型化的復制管理和位置設定轉換功能)。

Lotus Domino/Notes對移動用戶提供強有力的支持功能。離線(本地)存儲加密、雙向復制、字段級復制，大文檔截取與按條件進行的選擇性復制、離線目錄同步、復制器頁面對復制過程的監視、離線的web瀏覽、后臺操作能力(不影響前臺)等。選擇性復制意味著用戶或管理員可以在復制時定義所需復制的信息量，全部、某部分、僅僅是已修改等等。因而，采用Lotus Domino/Notes所設計和實現的應用能夠在線和離線模式工作，大大提高了所有用戶的工作效率，包括移動用戶。

工作流應用

從產品設計上看，MS Exchange幾乎不具備對工作流應用的支持。Exchange訪問控制模式沒有細化到支持象文檔級或子文檔級訪問控制，其數字簽名能力缺乏支持多個數字簽字功能，而且不能用于表單，其"過濾器"不支持基于時間調度的觸發方式。

Lotus Domino/Notes對文檔甚至文檔內的"區段"提供豐富的訪問控制手段。對工作流應用中必須的批準/否決操作，區段級訪問控制是十分有用的。同樣，基于角色的訪問控制手段使工作流管理更容易。Lotus提供的先進的數字簽名功能支持在單個文檔中多個數字簽名;在Domino服務器端運行的代理允許由事件和日程調度觸發。可以根據需要，使用多種方法編寫代理的，如Notes宏語言、"簡單操作"、LotusScript甚至是Java。

正如Gartner Group的工作流市場(WorkFlow Market，1998年3月)所載:

".....從功能上來說，MS Exchange比Domino、Groupwise有更多需填補的空間"。

快速應用開發

Lotus Domino的產品設計是圍繞應用開發，它使用戶可以快速簡單地開發應用系統，如工作流自動化。企業能夠充分利用Domino集成的開發環境的優勢，即它的文檔和表單驅動的應用開發模式，有效地縮短開發周期。這與Internet術語更類似，文檔是就是Web頁面，表單是描述Web頁面布局和內容的手段。這意味著Notes/Domino應用同時也是Web應用，并且更使Domino成為Web應用開發的唯一選擇的原因是，用戶通過簡單的編程或Script技術就能使開發的應用超越普通的Web發布，增加交互功能。

無論是企業內部應用還是對外的Web應用，使應用開發快速高效、又具備豐富功能的手段是充分利用Domino豐富的核心服務功能，象郵件/路由、目錄、安全、代理、復制等。簡單地說，Domino的應用開發策略是"偶而編程(Code-by-exception)"。

相反，Microsoft不提供相似的策略，而是"處處編程(Code-by-default)"。Exchange結構的核心基本上是一個電子郵件環境，而不是集成的開發平臺。它只提供對工作流應用以及與業務集成應用有限度的支持。為支持最基本的工作流應用，一些重要的性能如服務器端的Script代理與路由wizard(在Exchange的最新版本5.5中作為服務包提供)是在后來倉促地附加到基礎產品中來的。按照Microsoft Exchange應用開發人員的看法，用這些特性建立應用十分勉強。Microsoft所建議的，建立基于COM的軟件部件由此構造應用的策略，更是要求復雜的編程開發與集成技巧。這樣一來，為了能夠逐步達到單個Lotus Domino/Notes平臺所具備的基本功能，就必須有各式各樣的部件(Exchange，IIS，Active Server Pages，Visual Basic或Visual Studio工具，CDO和第三方提供的等等)的大規模集成，以及廣泛的客戶化編程。